Cumhurbaşkanlığı sisteminin ilk kararnameleri 16 bakanlıkla ilgili önemli değişiklikler öngörüyor. Son yetki KHK'sı ile kapanan ya da birleştirilen kurumların ardından 1 numaralı Cumhurbaşkanlığı kararnamesinde yeni bakanlık yapıları düzenleniyor. Buna göre kararnamede bazı kurumlar bakanlıklar arasında el değiştirdi. Örneğin İçişleri'ndeki Mahalli İdareler Çevre ve Şehircilik Bakanlığı'na geçti. Birçok birimin kurulmasına neden olan kanun kaldırıldı.